Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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MEIS3Q99687 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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MEIS3Q99687 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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MEIS3Q99687 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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MEIS3Q99687 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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MEIS3Q99687 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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MEIS3Q99687 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS3Q99687 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
MEIS3Q99687 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS3Q99687 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS3Q99687 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS3Q99687 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS3Q99687 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS3Q99687 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS3Q99687 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS3Q99687 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS3Q99687 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS3Q99687 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS3Q99687 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS3Q99687 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS3Q99687 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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