Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHDQ96IW2 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 334.1 ms