Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC47Q96A33 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC47Q96A33 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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