Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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