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| MCTP1 | Q6DN14 | Y_RNA.486-201 | ENST00000384398 | 107 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | MIR759-201 | ENST00000390224 | 91 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
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| MCTP1 | Q6DN14 | AC096725.1-201 | ENST00000514266 | 313 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | SCGB1D5P-201 | ENST00000515134 | 247 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
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| MCTP1 | Q6DN14 | MIR92B-201 | ENST00000607575 | 96 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | AC005562.2-201 | ENST00000618264 | 111 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | RBBP8-202 | ENST00000360790 | 2962 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | ASPN-202 | ENST00000375544 | 2470 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | OR13G1-202 | ENST00000642119 | 2568 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
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| MCTP1 | Q6DN14 | MIR422A-201 | ENST00000362286 | 90 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | SNORD114-7-201 | ENST00000362520 | 77 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | U3.8-201 | ENST00000363675 | 217 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | RNU6-944P-201 | ENST00000364023 | 107 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | RNU6-60P-201 | ENST00000364792 | 103 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | RNU6-1292P-201 | ENST00000383856 | 107 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | Y_RNA.545-201 | ENST00000384652 | 105 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | MIR577-201 | ENST00000385196 | 96 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | SNRPGP10-201 | ENST00000432323 | 225 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | RNU2-11P-201 | ENST00000459191 | 187 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | APOA2-205 | ENST00000468465 | 421 nt | TSL 2 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | RPL30P14-201 | ENST00000482744 | 348 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | RNU6-63P-201 | ENST00000516690 | 95 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | NCRNA00250-201 | ENST00000519500 | 519 nt | TSL 4 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | ETDC-201 | ENST00000635820 | 180 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | MIR376A2-201 | ENST00000636782 | 80 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | LRRC70-201 | ENST00000334994 | 2249 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | ZNF280D-201 | ENST00000267807 | 4328 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | AP003122.5-201 | ENST00000527668 | 3766 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | Y_RNA.298-201 | ENST00000364960 | 107 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | RNU6-1138P-201 | ENST00000365359 | 106 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| MCTP1 | Q6DN14 | RNY1P6-201 | ENST00000384193 | 109 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |