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| ANKRD40 | Q6AI12 | AC091959.1-201 | ENST00000495857 | 238 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | SCARNA24.2-201 | ENST00000516968 | 130 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | AC107973.1-201 | ENST00000530249 | 576 nt | TSL 4 BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
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| ANKRD40 | Q6AI12 | RNU1-142P-201 | ENST00000516682 | 145 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
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| ANKRD40 | Q6AI12 | SNORA63D-201 | ENST00000364359 | 132 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | SNORA16.1-201 | ENST00000364597 | 132 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
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| ANKRD40 | Q6AI12 | AL627230.6-201 | ENST00000611129 | 280 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
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| ANKRD40 | Q6AI12 | AC040936.1-201 | ENST00000534543 | 172 nt | TSL 5 BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | MIR4524B-201 | ENST00000581569 | 115 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | AC091178.2-201 | ENST00000584401 | 117 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | AL512605.2-201 | ENST00000592972 | 256 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | 5S_rRNA.19-201 | ENST00000612131 | 110 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | AL078604.3-201 | ENST00000615580 | 211 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | uc_338.20-201 | ENST00000621563 | 178 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | KCNQ1OT1_5.1-201 | ENST00000621902 | 226 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | 5S_rRNA.18-201 | ENST00000621941 | 110 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | GS1-279B7.1-204 | ENST00000641809 | 378 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | CEP57L1-201 | ENST00000359793 | 2515 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | ZNF702P-202 | ENST00000434269 | 1966 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | Y_RNA.44-201 | ENST00000362676 | 108 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | RNU6-112P-201 | ENST00000363599 | 104 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | Y_RNA.350-201 | ENST00000365409 | 98 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | Y_RNA.352-201 | ENST00000365439 | 102 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | RNU6ATAC19P-201 | ENST00000408096 | 110 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | AL591806.2-201 | ENST00000433122 | 173 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | RPL39P38-201 | ENST00000467018 | 153 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | SYT14-201 | ENST00000367015 | 5094 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | AC018630.2-201 | ENST00000534866 | 2403 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | XIRP2-201 | ENST00000295237 | 5246 nt | TSL 2 BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | AC245060.5-201 | ENST00000610778 | 3293 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | ATP13A3-201 | ENST00000256031 | 7322 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | RNA5SP276-201 | ENST00000362580 | 94 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |