Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ACKR1Q16570 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms