Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SCN9AQ15858 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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SCN9AQ15858 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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SCN9AQ15858 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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SCN9AQ15858 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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SCN9AQ15858 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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SCN9AQ15858 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
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SCN9AQ15858 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
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SCN9AQ15858 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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