Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PDE6HQ13956 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
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PDE6HQ13956 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
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PDE6HQ13956 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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PDE6HQ13956 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
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