Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.1 ms