Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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PKP1Q13835 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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PKP1Q13835 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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PKP1Q13835 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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PKP1Q13835 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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PKP1Q13835 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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PKP1Q13835 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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PKP1Q13835 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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