Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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FOXE3Q13461 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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FOXE3Q13461 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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