Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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CBX3Q13185 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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CBX3Q13185 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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CBX3Q13185 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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CBX3Q13185 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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CBX3Q13185 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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