Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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