Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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