Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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IFT88Q13099 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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IFT88Q13099 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
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IFT88Q13099 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
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IFT88Q13099 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
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IFT88Q13099 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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IFT88Q13099 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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