Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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TRAF1Q13077 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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TRAF1Q13077 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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TRAF1Q13077 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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TRAF1Q13077 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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TRAF1Q13077 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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