Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-1.03□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
GRIN2AQ12879 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
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GRIN2AQ12879 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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GRIN2AQ12879 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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GRIN2AQ12879 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
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GRIN2AQ12879 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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GRIN2AQ12879 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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GRIN2AQ12879 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
GRIN2AQ12879 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
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