Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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GTF3C1Q12789 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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GTF3C1Q12789 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
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GTF3C1Q12789 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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GTF3C1Q12789 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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GTF3C1Q12789 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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GTF3C1Q12789 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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