Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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HOXC5Q00444 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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HOXC5Q00444 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
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HOXC5Q00444 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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HOXC5Q00444 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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HOXC5Q00444 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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HOXC5Q00444 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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HOXC5Q00444 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
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HOXC5Q00444 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
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HOXC5Q00444 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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