Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTPAP49638 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTPAP49638 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TTPAP49638 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTPAP49638 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTPAP49638 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTPAP49638 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TTPAP49638 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TTPAP49638 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTPAP49638 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTPAP49638 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTPAP49638 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
TTPAP49638 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTPAP49638 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTPAP49638 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTPAP49638 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTPAP49638 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TTPAP49638 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTPAP49638 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.38
TTPAP49638 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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