Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
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PTPRMP28827 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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PTPRMP28827 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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PTPRMP28827 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
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PTPRMP28827 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
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PTPRMP28827 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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PTPRMP28827 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
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PTPRMP28827 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
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