Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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