Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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