Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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CITED1Q99966 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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CITED1Q99966 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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CITED1Q99966 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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CITED1Q99966 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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CITED1Q99966 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CITED1Q99966 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CITED1Q99966 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CITED1Q99966 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CITED1Q99966 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CITED1Q99966 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CITED1Q99966 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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