Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
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