Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN4Q92575 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.59□□□□□ -2
UBXN4Q92575 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN4Q92575 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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