Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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