Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTF1Q16619 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms