Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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