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Protein–RNA interactions for Protein: Q16143
SNCB, Beta-synuclein, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SNCB
Q16143
RNU6-205P-201
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107 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
SNCB
Q16143
AC096531.1-201
ENST00000419107
107 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
SNCB
Q16143
AC079354.2-201
ENST00000453523
154 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
SNCB
Q16143
RNU7-102P-201
ENST00000458948
62 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
SNCB
Q16143
RNU7-159P-201
ENST00000459284
62 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
SNCB
Q16143
snoU109.3-201
ENST00000459477
145 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
SNCB
Q16143
AC116353.2-201
ENST00000505332
712 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
SNCB
Q16143
AC093303.1-201
ENST00000514549
295 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
SNCB
Q16143
SNORA14.1-201
ENST00000516113
141 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
SNCB
Q16143
AL157392.4-201
ENST00000609756
345 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
SNCB
Q16143
RNU5F-3P-201
ENST00000363767
117 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNA5SP275-201
ENST00000363936
118 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU4-9P-201
ENST00000364951
139 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
Y_RNA.319-201
ENST00000365138
92 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU6-906P-201
ENST00000384700
70 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU6-903P-201
ENST00000391270
109 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MIR892B-201
ENST00000401279
77 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AL390729.2-201
ENST00000416137
156 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MTND4P32-201
ENST00000437189
1237 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AC018710.1-201
ENST00000506509
158 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
SCARNA8-201
ENST00000515924
131 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU7-129P-201
ENST00000516128
62 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AC100830.2-201
ENST00000581636
240 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
SNORD113-6-201
ENST00000363345
75 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
SNORA72.1-201
ENST00000363485
129 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MIR802-201
ENST00000390235
94 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MIR938-201
ENST00000401216
83 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU4-30P-201
ENST00000410245
143 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AL590730.1-201
ENST00000426283
398 nt
TSL 3
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RPL39P34-201
ENST00000477141
156 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AC069528.1-201
ENST00000490344
705 nt
TSL 3
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AC079467.1-201
ENST00000508512
503 nt
TSL 3
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU6-180P-201
ENST00000516697
61 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MIR5583-1-201
ENST00000580941
59 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
Z94722.1-201
ENST00000604328
474 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
NEAT1_2.1-201
ENST00000620525
105 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU6-280P-201
ENST00000364145
104 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU6-407P-201
ENST00000365280
104 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MIR106A-201
ENST00000384870
81 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MIR570-201
ENST00000384917
97 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MIR329-2-201
ENST00000385029
84 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNA5SP300-201
ENST00000391197
107 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
SNORA26.5-201
ENST00000391215
123 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MTCYBP4-201
ENST00000401524
249 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU2-54P-201
ENST00000410299
190 nt
BASIC
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□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
LINC00894-208
ENST00000455777
284 nt
TSL 2
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AC091959.1-201
ENST00000495857
238 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RN7SKP287-201
ENST00000516546
266 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
SNORD92-201
ENST00000585078
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BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AL591926.4-201
ENST00000616895
298 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNY4P34-201
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BASIC
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□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
SNORD114-12-201
ENST00000365400
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BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU6-1126P-201
ENST00000384002
107 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU6-159P-201
ENST00000391080
106 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AC090844.1-201
ENST00000422019
156 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AL356010.2-201
ENST00000422844
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TSL 3
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
LINC01870-201
ENST00000427042
390 nt
TSL 3
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
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436 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
TRBVB-201
ENST00000477100
408 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
LINC01487-202
ENST00000490497
423 nt
TSL 3
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
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763 nt
BASIC
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□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AL122017.1-202
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319 nt
TSL 5
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MIR4752-201
ENST00000579672
72 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MIR3152-201
ENST00000579801
74 nt
BASIC
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□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
PIGPP4-201
ENST00000584447
307 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
Z84480.1-201
ENST00000605131
311 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AC127459.3-201
ENST00000624328
466 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
SRP54-214
ENST00000630962
162 nt
TSL 5
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
Y_RNA.179-201
ENST00000363844
90 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
SNORD14C-201
ENST00000365382
88 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MIR196A2-201
ENST00000385189
110 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MIR153-2-201
ENST00000385225
87 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNA5SP163-201
ENST00000410304
99 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MLLT10P1-201
ENST00000418346
262 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MTCO2P27-201
ENST00000420740
428 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
SNRPGP10-201
ENST00000432323
225 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AL162734.1-201
ENST00000432858
157 nt
TSL 5
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU7-180P-201
ENST00000459240
63 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
PRDX4P1-201
ENST00000507189
574 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU6-504P-201
ENST00000516568
104 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
Y_RNA.696-201
ENST00000516725
107 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU6-897P-201
ENST00000517135
105 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MIR4264-201
ENST00000583520
66 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AC006380.1-201
ENST00000603598
186 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AC006504.8-201
ENST00000621046
635 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
5S_rRNA.13-201
ENST00000622298
123 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
SNORD38B-202
ENST00000625943
69 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AC007671.2-201
ENST00000637344
619 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
Y_RNA.280-201
ENST00000364765
112 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MIR125B2-201
ENST00000385128
89 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
MIR501-201
ENST00000390204
84 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
FGFR1OP2P1-201
ENST00000395943
500 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU6ATAC25P-201
ENST00000408798
117 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
RNU6-325P-201
ENST00000411132
105 nt
BASIC
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□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AC073626.1-201
ENST00000415146
582 nt
TSL 4
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AC133104.1-201
ENST00000429100
218 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
ZNF114P1-201
ENST00000453500
292 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
AL356010.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.49
SNCB
Q16143
SNORD126-201
ENST00000459475
77 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
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