Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.4 ms