Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
USF2Q15853 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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