Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SS18Q15532 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SS18Q15532 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SS18Q15532 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SS18Q15532 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SS18Q15532 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SS18Q15532 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SS18Q15532 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SS18Q15532 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SS18Q15532 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SS18Q15532 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SS18Q15532 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SS18Q15532 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SS18Q15532 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SS18Q15532 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SS18Q15532 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
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SS18Q15532 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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SS18Q15532 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SS18Q15532 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SS18Q15532 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SS18Q15532 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SS18Q15532 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SS18Q15532 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SS18Q15532 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SS18Q15532 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SS18Q15532 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SS18Q15532 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SS18Q15532 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
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