Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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PTPRKQ15262 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
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PTPRKQ15262 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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PTPRKQ15262 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
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PTPRKQ15262 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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PTPRKQ15262 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
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PTPRKQ15262 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
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PTPRKQ15262 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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PTPRKQ15262 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
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PTPRKQ15262 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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PTPRKQ15262 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
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