Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TNIP1Q15025 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNIP1Q15025 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms