Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PSMD6Q15008 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PSMD6Q15008 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 324.9 ms