Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
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SHPRHQ149N8 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
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SHPRHQ149N8 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
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SHPRHQ149N8 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
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SHPRHQ149N8 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
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SHPRHQ149N8 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
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