Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms