Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCARB2Q14108 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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