Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms