Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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