Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TMED1Q13445 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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TMED1Q13445 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
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TMED1Q13445 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
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TMED1Q13445 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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TMED1Q13445 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
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TMED1Q13445 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
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TMED1Q13445 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
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TMED1Q13445 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
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TMED1Q13445 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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TMED1Q13445 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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TMED1Q13445 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TMED1Q13445 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.46
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