Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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