Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ITGB3BPQ13352 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms