Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATMQ13315 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATMQ13315 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATMQ13315 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATMQ13315 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATMQ13315 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATMQ13315 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms