Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RIGQ13278 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RIGQ13278 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RIGQ13278 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
RIGQ13278 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RIGQ13278 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RIGQ13278 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
RIGQ13278 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
RIGQ13278 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIGQ13278 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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