Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LMAN2Q12907 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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