Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
AP3M2P53677 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
AP3M2P53677 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
AP3M2P53677 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
AP3M2P53677 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
AP3M2P53677 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
AP3M2P53677 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
AP3M2P53677 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
AP3M2P53677 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
AP3M2P53677 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
AP3M2P53677 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
AP3M2P53677 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
AP3M2P53677 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
AP3M2P53677 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
AP3M2P53677 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180 ms