Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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PTPRDP23468 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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PTPRDP23468 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
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PTPRDP23468 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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PTPRDP23468 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
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PTPRDP23468 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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PTPRDP23468 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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