Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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SH3BP4Q9P0V3 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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SH3BP4Q9P0V3 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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SH3BP4Q9P0V3 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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